Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT2Q7Z6L0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms