Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms