Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBR1LQ6UX01 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms