Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms