Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OPN5Q6U736 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms