Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBED9Q6R2W3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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