Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM236Q5W0B7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms