Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN4Q5BKX8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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