Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms