Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC93Q567U6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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