Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN2Q52LD8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms