Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPRNQ4KMQ1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TPRNQ4KMQ1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms