Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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KRTAP13-3Q3SY46 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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KRTAP13-3Q3SY46 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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KRTAP13-3Q3SY46 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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KRTAP13-3Q3SY46 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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KRTAP13-3Q3SY46 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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KRTAP13-3Q3SY46 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-3Q3SY46 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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