Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MICAQ29983 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MICAQ29983 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MICAQ29983 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MICAQ29983 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms