Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL24A1Q17RW2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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