Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IMPG1Q17R60 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms