Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTRK2Q16620 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms