Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms