Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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