Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CDSNQ15517 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CDSNQ15517 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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