Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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