Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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