Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCARF1Q14162 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms