Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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