Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
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