Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOFQ13790 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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