Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms