Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL4BQ13620 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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