Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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