Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms