Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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