Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
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