Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CTBP1Q13363 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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