Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CLN3Q13286 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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