Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFX1Q12986 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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