Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP3Q12983 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms