Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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FOXC1Q12948 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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