Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 319.18■□□□□ 0.668e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 VPS33A-205ENST00000541169 594 ntTSL 418.6■□□□□ 0.578e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.558e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.538e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.58e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 DEF8-204ENST00000561784 612 ntTSL 417.73■□□□□ 0.438e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 DISC1-207ENST00000422590 2939 ntTSL 1 (best)17.52■□□□□ 0.42e-8■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.398e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 216.72■□□□□ 0.278e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.248e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.188e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.138e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.098e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 DEF8-208ENST00000562578 573 ntTSL 415.11■□□□□ 0.018e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 MVB12A-210ENST00000529490 480 ntTSL 415.05■□□□□ -08e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-8■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.068e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.098e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.358e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 MVB12A-208ENST00000528911 820 ntTSL 512.31□□□□□ -0.448e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 SELENOI-203ENST00000447170 624 ntTSL 511.87□□□□□ -0.518e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.798e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 ZNF761-205ENST00000613950 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.848e-6■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 SRP54-AS1-201ENST00000554945 600 ntTSL 39.4□□□□□ -0.92e-8■■□□□ 11.6
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ILF3Q12906 CCDC47-207ENST00000612558 1586 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.048e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.118e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.128e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.138e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.148e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.158e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.178e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.178e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 DISC1-208ENST00000427560 545 ntTSL 37.67□□□□□ -1.182e-8■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.268e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.278e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.298e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.438e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ZNF512-206ENST00000488055 2465 ntTSL 26.11□□□□□ -1.438e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.438e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 GLS-207ENST00000417154 837 ntTSL 35.9□□□□□ -1.468e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 KLHL8-207ENST00000506985 2399 ntTSL 1 (best)5.71□□□□□ -1.58e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 SLC2A3-210ENST00000544291 577 ntTSL 55.49□□□□□ -1.538e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 LAMTOR5-AS1-238ENST00000626572 1044 ntTSL 55.43□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 VPS33A-203ENST00000536212 567 ntTSL 45.23□□□□□ -1.578e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ARHGAP5-211ENST00000557643 872 ntTSL 35.19□□□□□ -1.582e-8■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.62e-8■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.68e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.618e-6■■□□□ 11.6
ILF3Q12906 SLC2A3-211ENST00000544936 589 ntTSL 44.78□□□□□ -1.648e-6■■□□□ 11.6
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