Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROQ12816 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TROQ12816 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TROQ12816 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TROQ12816 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TROQ12816 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TROQ12816 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
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