Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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