Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms