Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RASGEF1BQ0VAM2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms