Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD47Q08722 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms