Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDR1Q08345 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms