Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms