Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms