Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms