Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL10A1Q03692 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL10A1Q03692 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL10A1Q03692 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms