Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms