Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SPCS3P61009 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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